國衛院核心儀器設施中心

蛋白質化學核心實驗室簡介

蛋白質體學(Proteomics)是對細胞、組織、器官或是整個生物體中全部蛋白質其功能和結構的大規模系統性的研究，國際生物醫學界有越來越多的研究人員利用蛋白質體學技術探討基礎及臨床醫學的特定課題，蛋白質體學的研究可說是繼基因體學後，生物醫學研究必然要走的道路。代謝體學(Metabolomics)是研究整體的代謝物分子，而這些代謝物是此生物體基因表達的終產物，是繼基因體學與蛋白質體學之後，成為新興的醫藥研究領域。質譜儀是研究蛋白質體學與代謝體學的一項利器，可應用於蛋白質身分鑑定(Protein identification)、蛋白質後轉譯修飾鑑定(Post-translational modifications)、蛋白質間的交互作用(Protein-protein interaction)和生物標誌的發現及鑑定(Biomarker discovery)。質譜儀可搭配多功能影像分析系統及二維電泳、DIGE及標定技術，提供研究人員進行蛋白質體學與代謝質體學定性及定量的研究。

高通量西方點墨分析系統(High-throughput Western blotting)為目前系統生物(system biology)另一最具效力的研究方式，可檢視大規模的系統或是大數量的樣品。視使用之特定抗體，此技術可用來研究各種信息傳導之網絡及蛋白質後轉譯修飾例如phosphorylation, acetylation, nitrosylation, ubiquitination, tyrosine nitration等等。此技術為本院細胞及系統醫學研究所及核心儀器設施中心的指導PI 褚志斌副研究員在美國芝加哥大學時參與發展出來的。

為提供研究人員進行蛋白質化學相關的研究，設置以下儀器由核心實驗室專人操作服務或供研究人員自行上機使用。本核心設施負責管理儀器、舉辦教育訓練、及提供諮詢服務。

技術平台

液相層析串聯質譜儀 (LC-MS/MS)
高通量西方墨點分析系統(Micro-Western Array)

一、液相層析串聯質譜儀 (LC-MS/MS)

結合液相層析儀的物理分離特性與質譜儀的質量分析能力之分析技術。質譜法是一個分析帶電離子的方法，當分析樣品進入質譜儀後，首先在離子源(ion source)進行游離化(ionization)使分析物轉換為氣相的帶電離子，進入質量分析器(mass analyzer)，在電場、磁場等物理力量的作用下，根據質荷比(mass-to-charge ratio, m/z)將離子做分離，偵測器(detector)可測得不同離子的質荷比，便可從電荷推算出分析物的質量。

一、高階四極柱飛行時間式串聯質譜檢測系統
(1)廠牌及型號：Waters Acquity UPLC-XeVo QTOF
(2)服務項目：代謝質體小分子定性檢測、胜肽及蛋白質分子量測定
(3)軟體：MarkerLynx XS
 
二、三段四極柱質譜檢測系統
(1)廠牌及型號：Waters Acquity UPLC-XeVo TQ
(2)服務項目：代謝質體小分子定量檢測
(3)軟體：TargetLynx
 
三、分子分析質譜儀系統
(1)廠牌及型號：Waters NanoAcquity UPLC-Synapt G2 HDMS
(2)服務項目：蛋白質體定性分析、蛋白質體定量分析
(3)軟體：ProteinLynx Global Server (PLGS)、Mascot、Distiller
 
四、高解析四極桿串聯傅立葉轉換電場軌道質譜儀
(1)廠牌及型號：Thermo Scientific QE PLUS
(2)服務項目：代謝質體定性分析、代謝質體定量分析
(3)軟體：Compound Discovery
 
技術師：
顏建隆博士 (分機#33712)
沈柏村博士 (分機#33722)
賴姿嘉         (分機#33709)
 
實驗室位置：R2-5217
指導PI：郭呈欽研究員  送件流程與收費標準 送測樣品注意事項、標準品清單線上預約申請、如何線上申請

酵素分裝服務

1.Trypsin $150/μg，廠牌：Promega

2.ZipTip $150/支，廠牌：Millipore

以上分裝皆包含所需使用到之reagent，請與Proteomics服務申請單一起填寫，線上預約申請。

欲分裝前，請先聯絡管理者：沈柏村博士 (分機#33722)

二、高通量西方墨點分析系統 (high-throughput Western blotting)

以微量細胞液微陣列分注平台(Nano-Plotter System)將檢體點在膠片上，再由水平電泳槽將蛋白質按大小分離，經過轉漬後進行西方墨點分析，最後由近紅外光螢光影像掃描分析儀(Odyssey Infrared Imaging System)掃描影像並分析。此系統可同時進行最多96組西方墨點分析，進而能迅速篩選可能的訊息傳遞路徑。目前實驗室已建置完成，並已備有600種抗體可供選擇。此項服務由核心實驗室專人操作並酌收耗材及檢測費用，並已於100年5月16日開放服務申請。

高通量西方墨點分析服務(Micro-Western Array)

            服務項目：高通量西方墨點微陣列(Micro-Western Array)服務
            
分析軟體：Licor Odyssey  
技術人員：朱康玲 (分機#33702/33713, e-mail:kanglinchu@nhri.org.tw)

實驗室位置：R2-5217

指導PI：褚志斌副研究員

2020 Antibody list for micro western array 

送件流程與收費標準

線上預約申請

小量抗體分裝服務        
 服務項目：基於資源共享，提供院內同仁小量分裝本核心實驗室現有之抗體。

如欲申請服務，請上核心設施中心網站填寫申請單  並請列印出服務單，送至核心設施中心蛋白質化學核心實驗室 (R2-5217)朱康玲(分機33702, 33713)收。

抗體分裝方式說明：

1.     抗體分裝以原包裝1/10為單位，收費1300元。

2.     每個實驗室每年每種抗體最多可分裝一個單位

3.     只接受院內計畫扣款方式。

實驗室位置：R2-5217

指導PI：褚志斌副研究員

2020 Antibost list for 小量分裝
線上預約申請

公用儀器

1. 多功能影像分析系統及二維電泳、DIGE技術分析軟體組合 (Typhoon Imager-Gel Image System Plus Software)

廠牌及型號：GE Typhoon Trio Variable mode Imager & DeCyder 2D software

2. 螢光分光光譜儀 (Fluorescent Spectrometer)

廠牌及型號：Varian Cary Eclipse

3. 圓偏極光分光光譜儀 (Circular Dichroism)

廠牌及型號：Jasco J-815 plus

4. 近紅外光螢光多功能掃描分析系統 ( Infrared Imaging System )

廠牌及型號：LI-COR Odyssey

使用規則

管理者：賴姿嘉 (分機#33709/33712, e-mail:greenjia912@nhri.org.tw)

液相層析串聯質譜儀 (LC-MS/MS)

高通量西方墨點分析系統(Micro-Western Array)

公用儀器